Group Leader/s
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intro
We are interested in all the biological processes where DNA is involved: replication, transcription, repair and recombination, how are they regulated and how they alter and are affected by epigenetic factors such as DNA topology and chromatin organization.
Members
| Pablo Hernández Valenzuela |
| Dora Beatriz Krimer Smunis |
| Jesus A. Carballo |
| Alicia Rodríguez Bernabé |
| Marta Fernandez Díaz |
| Andrea Negrin Lorenzo |
| Paula Alonso Ramos |
| Paula Alonso Ramos |
Selected Publications
Schvartzman J.B., Hernández P., Krimer D.B., Dorier J. and A. Stasiak [2019]. Closing the DNA replication cycle: From simple circular molecules to supercoiled and knotted DNA catenanes. Nucleic Acids Res. 47: 7182-7198
Castán A., Fernández-Calleja V., Hernández P., Krimer D.B., Schvartzman J.B. and M.J. Fernández-Nestosa [2017]. Analysis of DNA topology of EBV minichromosomes in HEK 293 cells. PLoS One 12:e0188172 (2017). DOI: 10.1371/journal.pone.0188172.
Fernández-Calleja V., Hernández P., Schvartzman J.B., García-de-Lacoba, Krimer D.B [2017]. Differential gene expression analysis by RNA-seq reveals the importance of actin cytoskeletal proteins in Friend Leukemia cells. PeerJ (doi/10.7717/peerj.3432)
Castán A., Hernández P., Krimer D.B.,Schvartzman J.B. [2017]. The abundance of Fob1 modulates de efficiency of rRFBs to stall replication forks. Nucleic Acids Res (doi: 10.1093/nar/gkx655)
Funding
BFU2017-87095-R. Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades. Impacto de disruptores endocrinos ambientales sobre células germinales femeninas en alteraciones epigenéticas transgeneracionales mediadas por RNAs pequeños no-codificantes. IP: Jesús del Mazo.
BIO2017-82951-R. Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades. Estudio de los factores que organizan el cromosoma de Streptococcus pneumoniae: nuevas dianas de antibióticos y mecanismos de resistencia. IP: Adela González de la Campa.
Programa PROCIENCIA del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), Componente I1. Fondos Concursables de Proyectos de I+D. PINV15-573 “Estructura y dinámica del ADN durante la replicación” PIs: Jorge B. Schvartzman y María José Fernández-Nestosa. 2017-2020.
Programa PROCIENCIA del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), Componente I3. Proyectos de Infraestructura y equipamiento para la Investigación. LABO16-102 “Centrífugación de alta velocidad para la separación de partículas de bajo coeficiente de sedimentación (minicromosomas, plásmidos, fagos y macromoléculas)” PI: María José Fernández-Nestosa. 2018-2020
Programa PROCIENCIA del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), Componente I1. Fondos Concursables de Proyectos de I+D. PINV18-122 “Efecto de la deleción de proteínas específicas del linaje hematopoyético sobre la reprogramación de la diferenciación en células eritroleucémicas”. PI: Dora B. Krimer. 2020-2021
BFU2014-56835-P. Ministerio de Economía y Competitividad. Dinámica de la topología del DNA y el papel de las topoisomerasas en transcripción, replicación, condensación, segregación, reparación y recombinación.
AECID, AP/038170/11, “Mecanismos moleculares de la diferenciación celular”, IPs: DB Krimer y MJ Fernández-Nestosa, (PCI 2011 AECID, 2011-2012)
I-COOP0009 (CSIC). “Impact of the SFFV retrovirus integration in erythroleukemia cells”, IPs: DB Krimer y MJ Fernández-Nestosa (2011-2013)