Biología Molecular de los Cromosomas

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Nos interesan todos los procesos biológicos en los que está involucrado el DNA: replicación, transcripción, reparación y recombinación, cómo están regulados y cómo modifican y son afectados a su vez por factores epigenéticos como la topología del DNA y la organización de la cromatina.

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a) Iniciación, elongación, bloqueo, terminación y topología de la replicación.

b) Identificación de genes involucrados en la diferenciación celular.

Head:

Dora Beatriz Krimer Smunis

c) Barreras para las horquillas de replicación e inestabilidad del DNA.

Head:

Pablo Hernández Valenzuela

Personal Científico
Pablo Hernández Valenzuela
Dora Beatriz Krimer Smunis

de Vasconcelos Junior, A., Tirado-Vélez, JM, Martín-Galiano, AJ, Megias, D, Ferrándiz, M-J; Hernández, P, Amblar, M, de la Campa, AG [2023]. StaR Is a Positive Regulator of Topoisomerase I Activity Involved in Supercoiling Maintenance in Streptococcus pneumoniae. Int. J. Mol. Sci. 24(6), 5973. https://doi.org/10.3390/ijms24065973

Cebrián, Jorge, Martínez, Victor, Hernández, Pablo, Krimer, Dora B., Fernández-Nestosa, María-José, Schvartzman, Jorge B. [2021]. Two-Dimensional Gel Electrophoresis to Study the Activity of Type IIA Topoisomerases on Plasmid Replication Intermediates. Biology 10 (11):1195. doi.org/10.3390/biology10111195

Schvartzman, Jorge B.; Martínez, Víctor; Hernández, Pablo; Krimer, Dora B.; Fernández-Nestosa, María-José [2021]. Changes in the Topology of DNA Replication Intermediates: Important Discrepancies Between in vitro and in vivo. BioEssays. DOI: doi.org/10.1002/bies.202000309

Ferrándiz, María J.; Hernández, Pablo; de la Campa, Adela G. [2021]. Genome-wide proximity between RNA polymerase and DNA topoisomerase I supports transcription in Streptococcus pneumoniae. PLoS Genetics 17(4): e1009542. doi.org/10.1371/journal.pgen.1009542

Martínez V., Schaerer C., Hernández P., Krimer D.B., Schvartzman J.B. and Fernández-Nestosa M.J. [2020]. Distribution of torsional tension between the un-replicated and replicated regions in partially replicated molecules. J Biomol Struct Dynamics. DOI:10.1080/07391102.2020.1751294

Schvartzman J.B., Hernández P. and D.B. Krimer [2020]. Topological barriers: Progression of DNA replication relies on DNA topology ahead of forks. BioEssays. DOI: 10.1002/bies.201900204

Sosa H., Fernández-Calleja V., Hernández P., Krimer D.B., Schvartzman and Fernández-Nestosa M.J. [2020]. Análisis de líneas celulares eritroleucémicas con deleciones de genes implicados en el desarrollo de enfermedades hematológicas severas. Doi:10.26885/rcei.foro.2019.19

Fernández-Calleja V., Fernández-Nestosa M.J., Hernández P., Schvartzman J.B. and D.B. Krimer [2019]. CRISPR/Cas9-mediated deletion of the Wiskott-Aldrich syndrome locus causes actin cytoskeleton disorganization in murine erythroleukemia cells. PeerJ 7:e6284

Schvartzman J.B., Hernández P., Krimer D.B., Dorier J. and A. Stasiak [2019]. Closing the DNA replication cycle: from simple circular molecules to supercoiled and knotted DNA catenanes. Nucleic Acids Res. 47: 7182-7198. DOI: doi.org/10.1093/nar/gkz586

Martínez V., Schaerer C., Fernández-Nestosa M.J., Hernández P., Krimer D.B., and Schvartzman J.B. [2018]. Topology of Partially Replicated DNA Molecules. Proceeding Series of the Brazilian Society of Computational and Applied Mathematics

Todas las publicaciones

BFU2017-87095-R. Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades. Impacto de disruptores endocrinos ambientales sobre células germinales femeninas en alteraciones epigeneticas transgeneracionales mediadas por RNAs pequeños no-codificantes. IP: Jesús del Mazo.

BIO2017-82951-R. Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades. Estudio de los factores que organizan el cromosoma de Streptococcus pneumoniae: nuevas dianas de antibióticos y mecanismos de resistencia. IP: Adela González de la Campa

Programa PROCIENCIA del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), Componente I1. Fondos Concursables de Proyectos de I+D. PINV15-573 “Estructura y dinámica del ADN durante la replicación” PIs: Jorge B. Schvartzman y María José Fernández-Nestosa. 2017 – 2020.

Programa PROCIENCIA del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), Componente I3. Proyectos de Infraestructura y equipamiento para la Investigación. LABO16-102 “Centrífugación de alta velocidad para la separación de partículas de bajo coeficiente de sedimentación (minicromosomas, plásmidos, fagos y macromoléculas)” PI: María José Fernández-Nestosa. 2018 - 2020

Programa PROCIENCIA del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), Componente I1. Fondos Concursables de Proyectos de I+D. PINV18-122 “Efecto de la deleción de proteínas específicas del linaje hematopoyético sobre la reprogramación de la diferenciación en células eritroleucémicas”. PI: Dora B. Krimer. 2020 – 2021

BFU2014-56835-P. Ministerio de Economía y Competitividad. Dinámica de la topología del DNA y el papel de las topoisomerasas en transcripción, replicación, condensación, segregación, reparación y recombinación. IP: Jorge Bernardo Schvartzman Blinder

AECID, AP/038170/11, “Mecanismos moleculares de la diferenciación celular”, IPs: DB Krimer y MJ Fernández-Nestosa, (PCI 2011 AECID, 2011-2012)

I-COOP0009 (CSIC). “Impact of the SFFV retrovirus integration in erythroleukemia cells”, IPs: DB Krimer y MJ Fernández-Nestosa (2011-2013)

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- Mención especial Premio Nacional de Ciencias año 2020 otorgado por la Cámara de Senadores de Paraguay por la obra titulada "Distribution of torsional stress between the unreplicated and replicated regions in partially replicated molecules" de los autores: Víctor Martínez, Christian Schaerer, Pablo Hernández, Dora Krimer, Jorge Schvartzman y María José Fernández.

Responsable/s del laboratorio

Pablo Hernández Valenzuela

Dora Beatriz Krimer Smunis

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