![Background image: Spectacular long-exposure view of the SpaceX Falcon 9 rocket launch toward space from Florida's Cape Canaveral Air Force Station on Sept. 21, 2014, carrying Seedling Growth 2 experiment toward the International Space Station (Image: ©SpaceX). INSET Photos: Several panels highlight the need of both in orbit operations (by Astroanut Tom Mashburn operating EMCS at the International Space Station, Image: ©NASA) and ground based activities (by Engineer Brit-Eli Danielsen at the experiment control and EMCS rooms at N-USOC, Norway) as complementary sides of any spaceflight experiment (Seedling Growth experiment patches and ground reference hardware are shown). picture](/sites/default/files/2020-12/imagen-web.jpg)
El pasado 25 de noviembre se publicaron simultáneamente en revistas del grupo editorial Cell Press una veintena de artículos científicos sobre biología espacial relacionados con la investigación en Space Omics. Dentro de ese paquete, el grupo de Nucléolo, Proliferación Celular y Microgravedad en Plantas, del Centro de Investigaciones Biológicas Margarita Salas (CIB-CSIC) ha publicado tres artículos, dirigidos por el Dr. Raúl Herranz, en las revistas iScience, Cell Systems y Patterns.
El Dr. Herranz es el coordinador en Europa del consorcio global International Standards for Space Omics Processing (ISSOP), que se describe en detalle en la publicación de la revista Patterns y que pretende estandarizar el acceso y procesamiento de los enormes volúmenes de datos generados en los últimos años en experimentos ómicos espaciales, tanto en organismos modelo como en humanos. Una aproximación integrada a estos conjuntos de datos permitirá comprender cómo afectan a los seres vivos factores como la radiación, la microgravedad o el aislamiento, aspectos cruciales no solo para una exploración espacial tripulada segura y efectiva, sino también para usarlo en la Tierra en investigación médica y biológica de patologías, especialmente aquellas relacionadas con el envejecimiento.
En este sentido, y para facilitar el almacenamiento, análisis y visualización de los datos recogidos en el espacio y sus experimentos análogos en la Tierra, la NASA ha puesto en marcha GeneLab, un recurso de acceso abierto para comparar los experimentos de biología espacial de las últimas dos décadas. La carta publicada en Cell Systems por Madrigal et al. describe la creación del Space Omics Topical Team financiado por la Agencia Espacial Europea (ESA), que se ocupará del apoyo a los científicos europeos que participan en GeneLab y potenciar el uso de las ómicas por la comunidad de biología espacial de la ESA. El equipo está constituido por expertos en biología espacial, bioinformática, y experimentación espacial de toda Europa, entre los que se incluye el Dr. Javier Medina y que se coordina en nuestro centro en Madrid por el Dr. Raúl Herranz.
El sistema de datos de GeneLab incluye experimentos con varios niveles de gravedad, alta radiación, así como el efecto de condiciones ambientales subóptimas (temperatura, humedad, composición del aire) en los distintos organismos. Precisamente los controles de estas condiciones experimentales tan extremas constituyen el principal obstáculo para la estandarización de este tipo de experimentos, como se pone de manifiesto en la publicación del experimento Seedling Growth, publicado en iScience por el grupo Nucléolo, Proliferación Celular y Microgravedad en Plantas del CIB Margarita Salas.
![iScience Cover](/sites/default/files/inline-images/cover_iScience.tif_.jpg)
Referencias:
The importance of Earth reference controls in spaceflight –omics experiments: An example from the Seedling Growth experiments. Aránzazu Manzano, Alicia Villacampa, Julio Sáez-Vásquez, John Z. Kiss, F. Javier Medina, Raúl Herranz (2020) iScience. DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2020.101686.
Revamping Space-omics in Europe. Pedro Madrigal, Alexander Gabel, Alicia Villacampa, Aránzazu Manzano, Colleen S Deane, Daniela Bezdan, Eugénie Carnero-Diaz, F Javier Medina, Gary Hardiman, Ivo Grosse, Nathaniel Szewczyk, Silvio Weging, Stefania Giacomello, Stephen D R Harridge, Tessa Morris-Paterson, Thomas Cahill, Willian A da Silveira, Raúl Herranz (2020) Cell Systems. Nov 9; S2405-4712(20)30413-0. https://doi.org/10.1016/j.cels.2020.10.006. Available at https://issop.space/space-omics-topical-team/
A New Era for Space Life Science: International Standards for Space Omics Processing (ISSOP). Lindsay Rutter, Richard Barker, Daniela Bezdan, Henry Cope, Sylvain V. Costes, Lovorka Degoricija, Kathleen M. Fisch, Mariano I. Gabitto, Samrawit Gebre, Stefania Giacomello, Simon Gilroy, Stefan J. Green, Christopher E. Mason, Sigrid S. Reinsch, Nathaniel J. Szewczyk, Deanne M. Taylor, Jonathan M. Galazka, Raul Herranz, Masafumi Muratani (2020) Patterns. https://doi.org/10.1016/j.patter.2020.100148
Más información:
Nota de Prensa CSIC: enlace