El CIB Margarita Salas es un centro multidisciplinar, integrando las disciplinas de biología estructural y celular, biomedicina, biotecnología, agricultura, medioambiente y química, y agrupando investigadores de las áreas de Biología, Ciencias Agrarias y Químicas.
El CIB Margarita Salas ha reorganizado sus líneas de investigación en tres programas científicos que proporcionan un marco para consolidar las sinergias entre los científicos del CIB para abordar cuestiones complejas. A continuación se describen los programas de investigación destacando sus objetivos científicos.